استجاب الباشا ولم يكن يعلم أن تلك الأوامر السلطانية تحمل في داخلها فخًّا لتحجيم قواته واستنزاف أمواله وجيوشه، صحيح أن العثمانيين سخّروا له المجندين وزودوه بالأسلحة، لكنهم كعادتهم يستأثرون بالفائدة الكبرى العامة.

على إثر احتلال العثمانيين المؤقت أجزاء من الجزيرة العربية من خلال واليهم محمد علي باشا، توجّه طموح الباشا جنوبًا سعيًا لاحتلال السودان وضمها لملكه، وبعدما استتب له الأمر، وجد السلطان العثماني محمود الثاني المشغول بملذاته أن ثورة كبرى تكاد تطيح بولاية اليونان، فسيَّر جيوشه المنهارة أصلًا، وبعد فشل عسكره طلب من واليه في مصر النجدة والتدخل، وكانت خطة الباشا الاستجابة السريعة لإثبات أهميته، وكان له ذلك، فكاد أن ينتصر لولا تدخل الدول الأوروبية المتمثلة في الروس والإنجليز والفرنسيين، وكادت الخسائر اللاحقة أن تعصف بحكم الباشا، الذي وجد أنه قد حان الوقت لفصل سياساته عن السلطان العثماني، وليعلن انسحابه وعودته إلى مصر.

خسر والي مصر في تلك الحرب حوالي ثلاثين ألفًا من جنده، وفقد معظم أسطوله البحري، بعد الضربة القاصمة التي أنزلها التحالف الأوروبي بالأسطول المصري والعثماني في موقعة نفارين البحرية سنة (1827)، فأحجم محمد علي باشا عن الاستمرار في مجابهة الأوروبيين، ورجعت بقايا أسطوله المُحطّم إلى الإسكندرية.

توقّع محمد علي باشا أن العثمانيين سيقدّرون له خدماته الكبيرة بحربه في الجزيرة العربية، بعد انتصارات السعوديين التي أذلت العثمانيين، خاصةً بعد أن استرد السعوديون الحرمين الشريفين من الاحتلال العثماني التركي، وفي اليونان حيث أُهين جيش السلطنة، إلا أن إحساس إسطنبول بخطر محمد علي باشا دفعها لتهميش دوره والتقليل منه، حتى أن السلطان لم يمنح الباشا إلا جزيرة كريت اليونانية، التي وجدها الباشا إهانة، بعد أن توقع الحصول على أقاليم كبرى مثل الشام.

ولأن الشام كانت بطبيعتها وجغرافيتها حاجزًا طبيعيًّا بين أتراك الأناضول والعالم العربي، تصاعدت أهميتها وأصبحت ساحة صراع دامية منذ احتلال العثمانيين للعالم العربي. لذلك خطط محمد علي باشا أن يضم بلاد الشام إلى ولايته رغمًا عن سلطانه العثماني، حتى يظفر بمواردها الاقتصادية ومهارة أبنائها الحرفية، وساعده في ذلك -كما تؤكد المصادر التاريخية – ضعف الدولة العثمانية بعد هزيمتها في الحرب اليونانية، ثم الحرب الروسية سنة (1829)، وكثرة الثورات والاضطرابات داخل السلطنة، يضاف إلى ذلك أن محمد علي استطاع أن يضم إلى تحالفاته  بشير الشهابي كبير أمراء لبنان.

واستطاعت قوات والي مصر أن تحقق انتصارات غير مسبوقة في بلاد الشام، فسيطرت على غزة ويافا وحيفا وصور وصيدا وبيروت وطرابلس، وفشلت محاولات الدولة العثمانية في وقف تقدم واليهم، لذا حشد العثمانيون عشرين ألف مقاتل وزحفوا لملاقاته، والتقى الجيشان في سهل الزراعة قرب حمص في إبريل (1832)، وانتصر على سلطنته في عكا الحصينة، ودمشق، وحمص، وتعد هذه المعركة من أهم معارك جيش محمد علي باشا لأنها أول معركة يتقاتل فيها جيشه ضد الأتراك وجها لوجه، وأظهر فيها تفوق جيشه الحديث.

وبعد هذه المعركة تقدّم جيش محمد علي فاحتل حماة وحلب، وانتصر على العثمانيين في موقعة بيلان، واجتاز حدود سوريا الشمالية، ودخل إبراهيم باشا بقواته ولاية أضنة في بلاد الأناضول.

وكانت ولاية أضنه مفتاح الأناضول، كان السلطان محمود الثاني وجهًا لوجه أمام الهزائم التي حاقت بجيشه، وأعدّ جيشًا جديدًا بقيادة الصدر الأعظم “محمد رشيد باشا”، وبلغ قوام هذا الجيش 53 ألف مقاتل، ونشبت معارك شرسة بين الفريقين، انتصر فيها الوالي محمد علي، وكان أهمها موقعة قونية 21 ديسمبر (1832)، التي فتحت الطريق أمامه إلى إسطنبول عاصمة الدولة العثمانية، إذ أصبحت قاب قوسين أو أدنى من سيطرة الباشا عليها.